「身上~」とは一般的には人の経歴、性格素行、家族関係など人に関するあらゆる調査の総称として使われているようです。
身元調査と何が違うのか・・?。厚生労働省の文献などに多く見られる「差別につながる身元調査云々と身上調査は何か違うのか。正直、業界でも特定の使い分けはされていなく、人権団体や行政でも「身上」との使い分けは出来ていないようです。ところが、身上調査、身元調査という言葉はごく普通に使われ、聞く人、話す人によってその言葉の意味する内容は違うようなのです。
辞書で引くと「身上(しん‐じょう、しん‐しょう)」は『その人に備わった価値。本領。とりえ。』や『一身に関すること。身の上。』とあります。※大辞泉
使われ方や解釈は色々あると思いますが、少なくとも「身上」という言葉に怪しいイメージはないのが本来なのではないでしょうか?